L'Archivio di Stato di Bari conserva circa 40 km di patrimonio archivistico, compreso in un arco cronologico tra l'XI secolo e la fine del XX, proveniente da enti, magistrature e istituzioni del periodo preunitario e da organi periferici dell'amministrazione dello Stato unitario, nonché archivi notarili, di coorporazioni religiose soppresse, di enti pubblici e di istituzioni private, e infine archivi di famiglie e di persone.
Per conoscere nel dettaglio i fondi e le raccolte si rimanda alla sezione dedicata, in cui la documentazione è suddivisa per tipologia, e dove è possibile scaricare gli inventari progressivamente informatizzati.
All'interno della sezione sono anche riportati i complessi archivistici conservati nelle Sezioni di Trani e Barletta.